传统感染性疾病病原体识别方法，细菌/真菌以培养为主，病毒以PCR/抗原抗体为主，支原体/寄生虫/包虫病以影像形态学为主。存在多重感染很难鉴定、大多微生物使用抗生素后无法培养、检测范围有限、检测内容有限、敏感率低、报告周期长等局限性。

2021年至今我国已陆续发布多篇临床应用专家共识，指导、推进病原微生物测序检测技术的规范应用。本文就2021-2023年已发表的12篇共识，概要汇总如下：

宏基因组二代测序技术在血液病患者感染病原诊断中的应用中国专家共识（2023年版）

发表时间：2023年8月

发表杂志：《中华血液杂志》

共识概要：该共识针对血液病患者感染诊断的临床送检mNGS适应症、样本采集与质量控制以及报告解读三个方面进行了讨论，并形成了16条相关建议，以期为mNGS在血液病患者感染诊断的规范应用提供指导。

成人呼吸道感染病原诊断核酸检测技术临床应用专家共识（2023）

发表时间：2023年8月

发表杂志：《协和医学杂志》

共识概要：该共识参考国内外指南及文献，分析了实时荧光聚合酶链反应（PCR）技术、等温扩增技术、数字PCR技术、核酸即时检测技术和病原体高通量测序技术的临床应用场景、技术特点和性能验证要求，以及该类技术在呼吸道感染中的应用，供临床借鉴参考。共识推荐病原体高通量测序在传统微生物检验未能明确病原或急需快速鉴别是否感染及其病原体时，有选择地使用，主要适用于呼吸道重症感染、疑似特殊病原体感染、聚集性呼吸道传播性感染患者。

宏基因组学测序技术在成人医院获得性肺炎中的临床应用专家共识

发表时间：2023年5月

发表杂志：《中国急救复苏与灾害医学杂志》

共识概要：共识简述了医院获得性肺炎使用mNGS在检测前，检测中，检测后各关键环节的质量控制，指出mNGS技术在罕见、新发病原体的诊断及溯源上具有显著优势，同时可提高肺部混合感染及真菌感染的诊断准确性。同时指出在有需求的医疗机构开展三代测序mNGS病原体检测，可以缩短检测周期，同时发挥床旁实时监控测序的优势，有助于HAP患者的快速诊断和制定治疗方案。

下呼吸道感染宏基因组二代测序报告临床解读路径专家共识

发表时间：2023年4月

发表杂志：《中华结核和呼吸杂志》

共识概要：共识明确了mNGS在下呼吸道感染病原诊断中的适用场景，为mNGS报告临床意义提供了一条合理可行解读路径，帮助规范mNGS在下呼吸道感染中科学合理应用。共识同时也指出tNGS相对于mNGS在LRTI应用中不容忽视的时效性、敏感性、特异性、性价比优势。

发表时间：2023年3月

发表杂志：《中华传染病杂志》

共识概要：针对靶向测序(tNGS)、宏基因组二代测序(mNGS)应用于分枝杆菌病诊断中“临床适应证和送检时机”、“标本的采集、检测、报告及实验室质量控制”、“临床结果判读”等临床存在疑惑的问题，专家组依据公开发表的研究数据和参与专家的应用经验而撰写本共识，以期提高该技术的临床应用水平。

发表时间：2022年6月

发表杂志：《中华儿科杂志》

共识概要：该共识对于儿科尤其新生儿重症监护病房（NICU）疑似中枢神经系统感染、疑似血流感染或疑似呼吸感染患儿的测序检测应用，标本采集和转运要求，以及报告解读规范共提出17点共识。

呼吸系统感染中宏基因组测序技术临床应用与结果解读专家共识

发表时间：2022年4月

发表杂志：《中华临床感染病杂志》

共识概要：该共识针对呼吸系统感染（包括病毒感染等上呼吸道感染，肺炎、肺脓肿、支气管扩张伴感染等LRTIs，以及胸腔感染）临床送检适应证、送检标本类型选择、检测质量控制及结果解读等问题，给出23条专业指导推荐，并指出mNGS在病原微生物耐药检测中的挑战。

发表时间：2022年3月

发表杂志：《中华实用儿科临床杂志》

共识概要：该共识针对呼吸道病原体核酸检测方法、推荐人群、标本类型及选择、结果解读及注意事项以及检测结果对临床用药指导价值几个方面指导儿童呼吸道病原体的核酸检测，提升儿童呼吸道感染病原体诊断能力。

发表时间：2022年1月

发表杂志：《中华检验医学杂志》

共识概要：该共识从常见感染性眼病临床表现和送检指征入手，规范眼部标本采集、转运、质量评估的方法和流程；强调眼科医师应与微生物检验人员充分配合，正确选择适宜的微生物检测方法，提倡床旁接种，同时针对刮片细胞学检查、传统微生物培养、棘阿米巴培养以及核酸检测、宏基因组测序等技术提出建议。

发表时间：2021年12月

发表杂志：《中华神经科杂志》

共识概要：从临床适应证和送检时机，标本管理、检测、报告及实验室质控，以及阳性、阴性报告的临床解读几方面，规范、提升脑脊液样本测序检测应用于中枢神经系统(CNS)感染的精准性。

发表时间：2021年9月

发表杂志：《中华检验医学杂志》

共识概要：该共识系统阐释病原微生物测序检测相关生物信息学分析的规范化管理内容，包括基本技术方案、以及分析平台基本要求。

发表时间：2021年2月

发表杂志：《中华检验医学杂志》

共识概要：针对测序技术应用于感染性疾病的临床适应证、微生物学适应证、耐药学适应证、流行病学和感染控制学适应证，及其基本流程和管理要求，诊断质量管理保证，诊断性能验证和标准化，以及报告解读等关键问题，提出38条共识推荐。