图a：Illumina Contig柱高代表通过Illumina平台测序得到的数据组装之后Contig的长度，Nanopore Min及Nanopore Max分别代表通过Nanopore平台测序得到的reads长度的最小值及最大值；图b：Nanopore与Illumina两个平台测序数据经过分析得到的抗生素抗性基因数。
 

研究领域	样品类型
人类健康	粪便、肠道内容物、牙菌斑、阴道分泌物、体液（唾液、灌洗液、脑脊液）
土壤环境	农田、林地、草原
水体环境	污水、河流、湖泊、海洋
极端环境	冻土、盐湖、冰川、火山
其他环境	植物体表、空气、生物反应器、模拟菌群

 
[1] Che Y , Xia Y , Liu L , et al. Mobile antibiotic resistome in wastewater treatment plants revealed by Nanopore metagenomic sequencing[J]. Microbiome, 2019, 7(1).

案例解析一  使用Nanopore高通量测序技术解析污水处理体系可移动抗性基因组
 


结果：
Nanopore测序reads N50达到5.8-10.7Kb，Illumina组装的contigs N50仅为1.7Kb。
Nanopore基于reads识别出1791个抗生素抗性基因（ARGs），Illumina的contigs只识别出316个ARGs。
进水口、出水口培养物中均观察到大量磺胺类耐药基因，证明持续耐药性与质粒有关。
多种类型的ARGs常位于同一质粒，Nanopore可检测到Illumina无法检测的多重耐药基因。
参考文献：Che Y , Xia Y , Liu L , et al. Mobile antibiotic resistome in wastewater treatment plants revealed by Nanopore metagenomic sequencing[J]. Microbiome, 2019, 7(1).
 
案例解析二  使用Nanopore测序从微生物组中获得细菌完成图

结果：