由于可变剪切（人类90%的基因表达的RNA存在可变剪切）的存在，一个基因往往对应多个转录本（lsoform），因此对转录本的定量非常有必要。传统的转录组只能对基因进行表达定量〈基于最长转录本进行GO、KEGG等分析），lsoform定量全长转录组可以实现转录本的定量，对基因的每一个Isoform进行功能注释。

基于lsoform定量全长转录组的多组学关联分析还原真实的系统生物学过程。