样本选择:2例前列腺癌患者的癌组织 研究结果:
2例患者的癌组织经过解剖,消化为单细胞,使用10× scRNA-seq测序,获得7904个细胞,主要分为15个细胞亚群,其中有3种类型管腔细胞。
CNV分析,推断PCa中1型管腔细胞可能为恶性细胞。拟时间轨迹分析,揭示在前列腺癌发展过程中分化为2种不同类型的恶性管腔细胞。
对1型管腔细胞进行聚类,鉴定到5个子亚群。在子亚群5中,与细胞生长相关的基因高表达。AMACR,GLYAT1和PCA3在子亚群5中特异性表达,表明子亚群5可能是临床上用于PCa诊断和分层的重要细胞群。
子亚群5的标记基因在PCa组织中高度表达。通过ROC分析,鉴定子亚群5中特异性最高的6个标记基因,包括AMACR、GLYATL1、HPN、PCA3、PCAT18和PLA2G7。表明,子亚群5对PCa的诊断和分层至关重要。
免疫染色验证,HPN在癌组织中高表达,且在高病理分级中的表达水平显著高于低病理分级。因此,作者判定HPN可能是临床PCa诊断和分层更特异、敏感的生物标记物。 参考文献
Ma X, et al. Identification of a distinct luminal subgroup diagnosing and stratifying early stage prostate cancer by tissue-based single-cell RNA sequencing. Mol Cancer, 2020;19(1):147.